Mikroobifusioloogia
Kuid uurides regulaatoreid,
mis aktiveerivad väga palju geene, mõisteti, et geenide regulatsioon on
ruumiliselt keerulisem. DNA molekulis võivad geenid asuda üksteisest kaugel,
kuid DNA tertsiaarstruktuur toob geenid üksteisele lähedale. Kui vaadata
bakterite genoomi kaarte, siis lineaarsel kaardil võivad teineteisest sõltuvad
geenid asuda väga kaugel.
Rohkem kui 100 bakteri genoomi uuriti bioinformaatiliselt ning leiti, et
teatud geenipaaridel on konserveerunud kaugus, need geenid eksisteerivad
bakteri kromosoomis teineteisest teatud kaugusel. E. coli's on selliseks sammuks
117 kbp, mis on täpselt ühe solenoidi või plektoneemi samm. Veelgi enam,
enamik sellistest geenidest oli lokaliseerunud genoomi piirkonda, mida aktiivselt
transkribeeriti. Lisaks 117 kbp sammule võivad geenid olla paigutunud veel
umbes 16 kbp ja 600 800 kbp tagant, mis vastab umbes mikrodomeeni ja
makrodomeeni pikkusele.