Molekulaardiagnostika kordamisküsimused
4. Markerid peavad olema erinevates kromosoomides.(et oleksid sõltumatud)
2.Isikutuvastamisel kasutatavad RFLP, STR ja SNP markerid: eelised ja puudused.
RFLP ja PCR meetodite võrdlus:
Analüüsimise aeg:
-RFLP:6-8 nädalat(radioaktiv.proov),1 nädal(kemiluminest.proov).
-PCR:1-2 päeva
Vajalik DNA kogus:
-RFLP:50-500ng
-PCR:0,1-1 ng
Automatiseeritavus:
-RFLP:ei
-PCR:jah
Vajaliku DNA kvaliteet:
-RFLP:kõrgmolekulaarne,intaktne DNA.
-PCR:võib olla degradeerunud
Miks STR-id on eelistatuimad geeneetilised markerid?
13
-Hõlpsalt (kiiresti) analüüsitavad
-Genoomis küllalt sagedased
-Erinevates populatsioonides väga varieeruvad
-Kodominantsed
-Väikese suurusega, võimalik multipleks analüüs
-Alleelide numbrid võimaldavad andmete digitaalset säilitamist
-Alleelsed redelid lihtsustavad interpreteerimist
-PCR võimaldab kasutada väga väikeseid
STR and SNP markerite võrdlus:
Esinemine inimgenoomis:
-STR: ~1 iga 15 kb kohta