Meditsiinilise mikrobioloogia praktikum
0 juures
TBE (tris-boraat) on veidi kallim, kuid suurema puhverdusvõimega. Kaheahelalise
lineaarse DNA fragmendid liiguvad umbes 10% kiiremini TAE-s kui TBE-s. Pikkade DNA
fragmentide jaoks on TAE lahutusvõime veidi parem kui TBE-l ja lühemaid fragmente lahutab
TAE halvemini kui TBE.
72
GEL-LOADING DYE. Segatakse uuritava prooviga enne geelile kandmist, et
1. suurendada proovi tihedust, mis tagab proovi vajumise geelihamba põhja;
2. värvida proov, mis lihtsustab pealekandmist.
DNA detekteerimine
Nukleiinhapete nähtavaksmuutmine geelil toimub peale foreesi. Selleks kasutatakse
• Etiidiumbromiidi (EtBr). EtBr seondub nukleiinhapetega ja fluorestseerub UV valguses
(302 nm), muutes DNA nähtavaks. Kuna ilma EtBr-ta geelis on DNA bändid teravamad ja
ilusamad, siis võib geeli värvida EtBr-ga peale foreesi. Selleks hoitakse geeli 30-45 min