"gccatctcatgcccatcgc" - 1 õppematerjal

Molekulaar- ja rakubioloogia praktikum

c. 56 kraadi juures 20 sekundit praimerite hübridiseerimine d. 72 kraadi juures 1 minut – ekstensioon e. Korrata alates punktist b. 24 korda. f. 10 minutit 72 kraadi juures, et pikendada poolikuks jäänud PCRi produktid Millist template DNA-d ja praimereid kasutasin? Mille järgi valitakse PCR praimerite hübridiseerimise ehk annealing temperatuur? Milline sulamistemperatuur on praimeril l 5’- GCCATCTCATGCCCATCGC -3’ standardtingimustel ja millist hübridiseerimistemperatuuri kasutaksin? Kuidas need leidsin? Hübridiseerimise temperatuur ja aeg sõltub kasutavate praimerite sulamistemperatuurist, amplifitseeritava DNA konsentratsioonist ja reaktsioonisegu koostisest. Antud järjestuse sulamistemperatuuriks on 59,3 kraadi, mille leidsin: http://eu.idtdna.com/site/Order/oligoentry/set? seq=GCCATCTCATGCCCATCGC. Kasutaksin hübridiseerimistemperatuuriks 59 kraadi. Mille järgi valitakse ekstensiooniaeg