“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid
A-minoor I. A1493 täidab väikese vao kogu ulatuses.
A1493 kontakteerub koodoni 1 nt, antikoodoni 3. Nt. See on A-minoor I
interaktsioon. A minor I on tundlik k-ak paari geomeetria suhtes. G-U mismatch
kaotab H-sideme A1493 ja U1 2’-OH vahel. Mismatchi energeetiline hind 16-40
kJ/mol.
2. Koodoni positsioonis.A1492 täidab poole väikesest vaost. A1492 kontakteerub
koodoni teise nt ja antikoodoniga läbi G530-i. See on A minor II interaktsioon.
Oluline on ka valgu S12 Ser50. G-u mismatch kaotab A1492 kontakti koodon-
antikoodon paariga, selle hinnaks on 15-20 kJ/mol.
3. Koodoni positsioonis. Wobble. 16S rRNA ei interakteeru koodon-antikoodon
paariga. Dekodeeriv tsentr k-ak paari kuju suhtes „tundetu“. Koodoni kolmandas
positsioonis on võimalikud ebastandartsed aluspaarid – Wobble (G-U, I-A, I-C).
30S „sulgumine“
annaabi.ee 
