"g116" - 1 õppematerjal

“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid

“Tripeptiidne antikoodon” - : domeenis II, P(A/V)T – RF1, SPF – RF2, vajalik STOP-koodoni äratundmiseks. “antikoodoni” vahetus RF1 ja RF2 vahel paneb RF1 ära tundma RF2 koodonit (UGA) ja vice versa (Ito et al. 2000). RF1/RF2. Pos 1. Ainult pürimidiin (C,U) mahub  19 “seondumise taskusse” Aga C ei annaks vajalikke H-sidemeid RF1 jääkidega T186 ja G116↓ Seega sobib ainult U. RF1. Pos2. Pürimidiinid (C,U) ei anna hüdrofoobseid interaktsioone U1 ja Glu119/Pro184-ga Jäävad puriinid A ja G. Aga G ei annaks vajaliku H-sidet RF1 jäägiga T186. Seega sobib ainult A. RF2. Pürimidiinid ei annaa vesinuk sidemeid. Seega Avõi U. RF1pos3 Avõi U, RF2- C ja U ei anna hüdroboobseid sidemed. Peptidüül-tRNA estersideme hüdrolüüsiks vajalik GGQ (glütsiin, glütsiin, glutamiin) motiiv RF1/2 domeenis 3.