Molekulaar- ja rakubioloogia
fragmentid hakkavad liikuma katoodile. Mida väiksem on DNA
jupp, seda kiiremini ta liigub geelis, sellega väiksemad jupid
elektoforeesi lõpus asuvad geeli põhjas (katoodi lähemale) ka
suuremad geeli ülemises osas.
Et umbkaudu teada oma DNA fragmenti pikkus, panime ka
jooksma DNA ladderi, mille järgi saab võrrelda ja ennutada DNA pikkused.
15 minuti möödudes, meie DNA
fragmentud lahutusid ja geelilõik on
valmis pilldistamiseks. Pildistamine
toimub uv-lampide all, ning DNA
lõigud on nahtavad tänu nende
interkaleerumisele EtBr-ga.
Analüüsides oma PCR produkti, saab