Meditsiinilise mikrobioloogia praktikum
Et saavutada >2kb
DNA fragmentide maksimaalne lahutuvus, tuleks geeli jooksutada tingimuses, kus oleks 5-8V/cm
kohta.
AGAROOSI TÜÜP. Agaroosid jagatakse:
• standardagaroos
• madala sulamistemperatuuriga agaroos (low melting agarose)
• vahepealse sulamis-geelistumistemperatuuriga agaroosid
Igas grupis on erinevaid agaroositüüpe, mida kasutatakse vaid teatud juhtudel.
ELEKTROFOREESI PUHVER. DNA liikumist mõjutavad elektroforeesipuhvri koostis ja
ioontugevus. Ioonide puudumisel (kui foreesipuhvri asemel oleks vesi) on elektrijuhtivus
minimaalne ja DNA migreerub väga aeglaselt või üldse mitte. Väga kõrge ioonse jõuga puhvris
(nt. 10× foreesipuhver) on elektriline juhtivus väga kõrge ja eraldub palju soojust isegi keskmistel
pingetel. Selle tulemusena võib geel sulada ja DNA denatureeruda.
Elektroforeesipuhvrid tehakse tavaliselt kontsentreerituna ning neid hoitakse
toatemperatuuril. TAE (tris-atsetaat) puhver on neist kõige väiksema puhverdusvõimega ning