Valkude ruumiline struktuur
Kas sekundaarstruktuur on ennustatav primaarstruktuurist
lähtudes?
Chou ja Fasman 1976
·Homoloogia alusel modelleerimine
·Valkude kokkupakkumise modelleerimine
·Irregulaarsused standardsetes struktuurides
·Helix capping (Asn, Gln)
Valgud jaotatakse ajalooliselt globulaarseteks ja
fiibervalkudeks
Esialgne jaotus morfoloogia alusel
Fiibervalgud domineerib 1 sekundaarstruktuur
Fiibervalgud on tüüpiliselt vees lahustumatud
kasutusel sidekudedes
Näited: Kollageen, keratiin, siidi fibroiin
Globulaarsed valgud vees lahustuvad.
Enamus valke rakkudes.
Heterogeense sekundaarstruktuuriga.
Oluline tertsiaarstruktuur
tuleneb ebareeglipärastest kõrvalahelate interaktsioonidest