Mikroobifusioloogia
perekonnast erinevad. E. coli's on selleks N, mis on vajalik N-metabolismi
geenide ekspressiooniks. Erinevalt sigmaD-tüüpi sigma faktoritest vajab sigmaN
transkriptsiooni initsieerimiseks alati aktivaatoreid, mis võivad seonduda DNA-ga
promootorist ebatüüpiliselt kaugel.
Eraldi alternatiivsete sigma faktorite rühma moodustavad sigmaD
superperekonda kuuluvad ekstratsütoplasmaatilise funktsiooniga sigma faktorite
alamperekond ECF (inglise keeles extracytoplasmic function). Need alternatiivsed
sigma faktorid reguleerivad raku ümbrisega seotud funktsioone, nagu
sekretsioon, ekstratsellulaarsete faktorite süntees, toitainete omastamine ja
transport. Pseudomona areuginosa's on leitud 19 ECF sigma faktorit, Bacillus
subtilises 7 ECF sigma faktorit. Need alternatiivsed sigma faktorid on enamik
ajast seotud membraaniseoseliste antisigmafaktoritega ning inaktiveeritud. Õige
keskkonna signaali korral need alternatiivsed sigma faktorid vabanevad