Molekulaar- ja rakubioloogia
kasutasime kõik sama programmi, siis on valitud pigem pikem aeg (valitud on 3 minutit,
lühemate järjestuste puhul piisaks ka 1 minutist). Korduste arv sõltub sellest, kui palju on vaja
DNA-d saada, samas liiga palju tsükleid suurendab vigade tõenäosust.
c)
Geelipildilt on näha, et PCR on tõenäoliselt ebaõnnestunud, kuna bändi pole näha (peaks
olema noolega märgitud kohas). Põhjuseks võib olla ebatäpsus. Edasiseks tööks sain L-Envo
pEGFP-C2.
2. PCR-i produkti puhastamine
a) Kaalusime 1,5g agaroosi, viisime mahu TAE puhvriga 100ml-ni ja kuumutasime segu
mikrolaineahjus, kuni agaroos täielikult lahustus. Seejärel jahutasime lahust ringjate
liigutustega loksutades. Jahtunud segule lisasime 0,5l EtBr, loksutasime ning valasime
lahuse geelialusele. Lasime geelil tarduda.
b) Kuna produktide pikkus varieerus 300-2000 bp vahel, siis valmistasime 1,5% agaroos
geeli