BIOinformaatika kodutöö 5
1021 gtttatctcg atagcaaaat tactatcgcc tga
3. SPdbV (http://www.expasy.org/spdbv/) kasutamine.
a. Leida vastavate valkude ruumiliste struktuuride PDB failid (alternatiiv http://www.rcsb.org/pdb/) ja
laadida need arvutisse ning kirjeldada neid (peaahela käik, sekundaarstruktuuride olemasolu ja ulatus,
elektrostaatilised ja molekulaarsed pinnad).
Peaahela käik
Sekundaarstruktuurid
Elektrostaatilised pinnad
Molekulaarsed pinnad
4. Andmete otsimine NCBI-st Entrezi kaudu (http://www.ncbi.nih.gov/)
a.Leida Drosophila melanogaster püruvaatkinaasi kodeeriv geen NCBI RefSeq-s (geeni tüüp, kirjeldus,
nimi, funktsioon, protsessid), töötada MapVieweriga.
Gene name
CG7069
Gene description
CG7069
Gene type
protein coding
Function Evidence
carbohydrate kinase activity IEA
pyruvate kinase activity ISS
Process Evidence