Biokeemia proteolüütilineensüüm
Paljud bakteriaalsed proteaasid, nagu subtilisiiin, savinaas, alkanaas jt omavad nõrka
spetsiifikat ja lagundavad valkudes praktiliselt kõiki peptiidsidemeid, produtseerides vabu
aminohappeid. Ka mina kasutasin selles katses sellist proteaasi, alkanaasi.
Kui proteaas toimib polüpeptiidahela kesksetele peptiidsidemetele on tegemist
endopeptidaasiga, kui otsmistele, siis eksopeptidaasiga. Selles katses kasutasin
endopeptidaasi. Eksopeptidaasid on näiteks karboksüpeptidaasid ja aminopeptidaasid, mis
lühendavad peptiide, vabastades ühekaupa C- või N- terminaalseid aminohappeid.
Ensüümi toimimise optimaalse keskkonna pH väärtuse järgi eristatakse hapusid
(pH=2,5), neutraalseid (ph=7,2) ja leelisproteaase (pH=9,0).
Proteaase klassifitseeritakse aktiivtsentri ehituse (millised aminohapped sellesse
kuuluvad) järgi, millest tuleneb ensüümi toimemehhanism. Neli peamist rühma on seriin -,