Populatsioonigeneetika eksam
üksikute proovide tasemel.
Põhikomponentanalüüsi puhul näeme erinevaid kihte samas kui Fst puhul on
kogu erinevus ühte dimensiooni taandatud.
6. Kirjelda Structure-sarnaseid meetodeid populatsioonide
geneetilise struktuuri hindamisel. Millel need meetodid põhinevad.
Mida tuleb tulemusi interpreteerides silmas pidada. Ja mille põhjal
saab hinnata segunemise (suhtelist) vanust.
Põhinevad ellasseisundi määramisel -päritolukoefitsentide määramisel
statistilise mudeli parameetritena.
Põhimõte – mudeldatakse populatsioonistruktuuri leidmaks kombinatsioon
“algpopulatsioonide” alleelisagedustest ja uuritavate indiviidide
“päritolumustrist”, mis maksimaalselt vähendab HWE ja ahelduse (LD)
tasakaalutust.
ADMIXTURE konstrueerib uurija poolt defineeritud arvu hüpoteetilisi
algpopulatsioone ja hindab igale uuringusse kaasatud proovile tõenäosuse