Mikroobifusioloogia
organismid rühmadesse. Baktereid, mis kasutavad energiaks valgust,
nimetatakse fototroofideks (tsüanobakterid). Baktereid, mis ei ole võimelised
valgust energiaallikaks kasutama vaid saavad energiat oksüdeerimise abil,
nimetatakse kemotroofideks. Baktereid, mis energia saamiseks oksüdeerivad
anorgaanilisi ühendeid, nimetatakse litotroofideks. Neid, mis oksüdeerivad
orgaanilisi ühendeid, nimetatakse organotroofideks. Teisiti öelduna, litotroofid
kasutavad elektronidoonoriteks anorgaanilisi ühendeid ning organotroofid
orgaanilisi ühendeid. Süsiniku kasutamise järgi jaotatakse bakterid
autotroofideks ja heterotroofideks. Autotroofid suudavad fikseerida
anorgaanilist süsinikku CO2 (süsinik-hapnik side). Heterotroofid saavad süsiniku
orgaanilistest süsinikallikatest (süsinik-vesinik sidemetega molekulid). Enamik
baktereid on heterotroofid.
Peaaegu kõik eukarüoodid on fotoautotroofid (taimed) või heterotroofid
(loomad, seened, algloomad)