Evolutsioon: usk, Darwin
kasutatakse ära
enam infot.
Muidugi oleks kena, kui säästuprintsiibi ja distantsi alusel saadud fülogeneetilised puud
langeksid kokku. Lahknevuse (vastuolu) puhul eelistatakse tavaliselt parsimoonset puud, sest
parsimoonia on teoreetiliselt korrektsemal alusel. Viimastel aastatel on ilmunud ridamisi töid,
kus on konkreetset fülogeneetilist ülesannet lahendatud paralleelselt mitme meetodiga, samuti
spetsiaalseid töid, kus kas otseste eksperimanetaalsete andmete või simulatsioonidega on
võrreldud eri meetoditega saadud puid ja tuletatud heuristilisi reegleid, millal kasutada seda
ehk teist fülogeneetilise puu tuletamise meetodit.
Reaalsete ülesannete lahendamisel kasutatakse vastuolulisi tulemusi üsna sageli. Osalt on
põhjus ka selles, et enamus “lihtsaid” probleeme on juba lahendatud: allesjäänud küsimused
ongi oma olemuselt keerulised. Tüüpiliseks on olukord, kus osa tunnustest toetab üht, teine osa
teist puud