Vajad kellegagi rääkida?
Küsi julgelt abi LasteAbi
Logi sisse
Sulge

"eellaspopulatsioon" - 1 õppematerjal

Populatsioonigeneetika 2014
52
doc

Populatsioonigeneetika 2014

Termin tuleb esimesest sellisest analüüsivahendist, mille nimi on STRUCTURE. Mudelil põhinev eellasseisundi määramine – päritolukoefitsentide määramine statistilise mudeli parameetritena (ADMIXTURE, FRAPPE, structure). Põhimõte seisneb selles, et mudeldatakse populatsiooni struktuuri leidmaks kombinatsioon „algpopulatsioonide“ alleelisagedustest ja uuritavate indiviidide „päritolumustrist“, mis maksimaalselt vähendab HWE ja ahelduse (LD) tasakaalutust. Oluline on, et „eellaspopulatsioon“, mida rekonstrueeritakse, ei ole reaalne, kunagi eksisteerinud populatsioon formaalses mõttes. Tegelikult struktureeritakse vaid tänapäevast geneetilist varieeruvust. Nüüdseks on väga populaarne ADMIXTURE, sest see on kiire. Konstrueerib uurija poolt defineeritud arvu hüpoteetilisi algpopulatsioone (k) ja hindab igale uuringusse kaasatud proovile tõenäosuse, millega ta pärineb igast ühest neist hüpoteetilistest algpopulatsioonidest

Bioloogia → Bioloogia
6 allalaadimist


Sellel veebilehel kasutatakse küpsiseid. Kasutamist jätkates nõustute küpsiste ja veebilehe üldtingimustega Nõustun