Populatsioonigeneetika 2014
6. Mis on lõputute saitide mudel ja milleks seda vaja on? Kas saame alati eeldada selle kehtimist?
Natalja
Iga geen on tehtud saitide järjestusest ja igal korral kui mutatsioon toimub, ta mõjutab saitile, mis eelnevalt oli
mõjutamata.
7. Selgita populatsiooni diversiteediparameetrit Θ (teeta) ja seda defineerivat valemit! Mis on lihtsaim
viis teeta väärtuse hindamiseks DNA järjestuste alusel?
Teeta on kahe järjestuse vaheline keskmine erinevus. Kuna keskmiselt elas kahe geeni ühine eelasgeen 2Ne
põlvkonda tagasi, siis järelikult lahutab kahte geeni 2 korda 2Ne põlvkonda ehk 4Ne põlvkonda. Kui teame
mutatsioonide tekkesagedust ühes põlvkonnas, siis saame arvutada välja teeta ehk kahe järjestuse vahelist
keskmist erinevust θ=4Neμ.
8. Selgita lühidalt, mis on “skyline” mudel populatsiooni efektiivse suuruse hindamiseks.
Ne= uk(k-1)/2. Ne pop.suurus ajal; u aja pikkus; k liinide arv. Lävendist lühemad intervallid liidetakse naabriga.
9
annaabi.ee 
