Evolutsioon: usk, Darwin
ehk teist fülogeneetilise puu tuletamise meetodit.
Reaalsete ülesannete lahendamisel kasutatakse vastuolulisi tulemusi üsna sageli. Osalt on
põhjus ka selles, et enamus “lihtsaid” probleeme on juba lahendatud: allesjäänud küsimused
ongi oma olemuselt keerulised. Tüüpiliseks on olukord, kus osa tunnustest toetab üht, teine osa
teist puud. Küsimus on selles, milliste reeglite alusel kõrvaldada uuringuist need jagatud
tunnused, mis on ebasusaldatavad.
Suurim osa klassikalisest fülogeneetiliset tööst on tehtud morfoloogiliste tunnuste võrdlemisel.
Siin on oluline eelistada homoloogiat analoogiale (teha vahet homo- ja analoogia vahel). Siinses
kontekstis nimetame:
homoloogseks niisugust tunnust, mida kaks või enam liiki jagavad oma ühise esivanemaga;
analoogseks niisugust tunnust, mida jagavad kaks ehk enam liiki, kuid need liigid ei jaga seda
oma ühise esivanemaga.