Molekulaarne evolutsioon
puu ja mudeli parameetrite põhjal. Klassikaliselt on bootstrap-
meetod mitteparameetriline ehk me ei tee jaotuse kohta mingeid
eelduseid. Juhul kui meil on aga teada, millisesse jaotusesse võiks
uuritav tunnus kuuluda, on võimalik kasutada parameetrilist
bootstrap meetodit.
44. Mida hindab kooskõlaaste (goodness of fit) ja mida
püsivusindeks (consistency index) ning kuidas need
arvutatakse?
Kooskõlaaste hindab distantsmeetodiga konstrueeritud puu sobivust
andmetega.
d – distantsmaatriksis esitatud
kaugushinnang α p – patristiline (puult mõõdetud)
kaugus
Püsivusindeks mõõdab andmete ja puu sobivust. Ühe informatiivse
positsiooni kohta:
mj – minimaalne võimalik asenduste arv j-ndas
positsioonis antud positsioonile kõige säästlikuma
ci=mj/sj topoloogia korral