Molekulaarne evolutsioon
võrdlemisel tuvastatud asenduste arv jagatud järjestuse pikkus.
26. Mida tuleb arvestada DNA evolutsiooni mudeli
valimisel?
mida rohkem on mudelil parameetreid, seda paremini kirjeldab see
tegelikkust, aga seda suurem on parameetrite hindamisest tulenev
määramatus. Tuleb kasutada minimaalset arvu parameetreid, mis
annavad mõistliku tulemuse.
Fülogeneesipuude konstrueerimise meetodid
27. Võrrelge distantsmeetodeid meetoditega, mis
kasutavad diskreetseid tunnuseid.
Distantsmeetodid – kõigepealt arvutatakse järjestuste geneetilised
kaugused, leitakse kõikide paaride kaugused, koostatakse kauguste
maatriks ja selle põhjal arvutatakse puu:
Arvutavad joondatud järjestuste paariviisiliste kauguste
maatriksi
Tuletavad puu topoloogia
Hindavad iga haru pikkust
Diskreetsetel tunnustel põhinevad meetodid: