"dissotsiatsioonifaktor" - 1 õppematerjal

Molekulaarbioloogia konspekt

IF-2 ja IF-3 esinevad kõigil bakteritel. IF-2 seob GTP juuresolekul initsiaator-tRNA'd, mis bakterites on fMet-tRNAfMet. Sellise kolmik-kompleksina seondub IF-2 ribosoomi väiksema subühikuga ja moodustab viimasega stabiilse kompleksi. IF-2 on GTP'd siduv valk ja tal on teistele GTP'ga seonduvatele valkudele omane valgudomään nn. GTP domään. IF-2 omab GTP'd hüdrolüüsivat tsentrit, mis aktiveerub intsiatsiooni käigus ja on sõltuv ribosoomide suuremast subühikust. IF-3 on ribosoomide dissotsiatsioonifaktor, ta takistab ribosoomide subühikutel assotseerumast, võimaldades niiviisi vabade 30S subühikute olemasolu, mis on vajalikud mRNA ja IF-2.GTP.fMet-tRNAfMet kompleksi sidumiseks. Initsiaator-tRNA, mis prokarüootides on fMet-tRNAfMet, erineb veidi tavalistest tRNA'dest. Esimene nukleotiid ei ole initsiaator-tRNA's paardunud. Teistel tRNA'del on esimene nukleotiid paardunud 72. nukleotiidiga. Ka antikoodon õla struktuur on veidi erinev (vt. joon. 8.13). Need erinevused on vajalikud,