Mikroobifusioloogia
süntees väheneb. Kui valkude süntees on stabiliseerunud (piisavalt aminohappeid
ribosoomide kohta), siis SpoT lagundab (p)ppGpp.
Alarmoonist sõltuvatel promootoritel on iseloomulik
diskriminaatorjärjestus, mis on -10 elemendi ja transkriptsiooni alguspunkti
vahel olev GC-rikas järjestus. Diskriminaatori abil pärsitakse avatud kompleksi
avanemist ning transkriptsiooni initsiatsiooni, sest GC-rikas ala takistab ahelate
lahtisulamist, mis päädib RNAP dissotseerumisega DNA-lt. Ühe hüpoteesi kohaselt
ppGpp seondub diskriminaatorjärjestuses olevate C-nukleotiididega ning takistab
sedasi promootori vabastamist.
Promootorid, mida ppGpp pärsib, on diskriminaatorjärjestusega
promootorid, mis on aktiveeritavad negatiivse superspiralisatsiooniga. Tavaliselt
on selliste promootorite vaheala lühem N=16. Seevastu promootorid, millel on
diskriminaatorpiirkonnas AT-rikas järjestus või on pikema vahealaga N=18 pole
ppGpp-ga represseeritavad
annaabi.ee 
