Mikroobifusioloogia
Selle geeni transkriptsioon on
tugevalt represseeritud kui DNA globaalne negatiivne superspiralisatsioon
väheneb. Seega, kui rakud sisenevad statsionaarsesse kasvufaasi, siis ppGpp
süntees väheneb. Kui valkude süntees on stabiliseerunud (piisavalt aminohappeid
ribosoomide kohta), siis SpoT lagundab (p)ppGpp.
Alarmoonist sõltuvatel promootoritel on iseloomulik
diskriminaatorjärjestus, mis on -10 elemendi ja transkriptsiooni alguspunkti
vahel olev GC-rikas järjestus. Diskriminaatori abil pärsitakse avatud kompleksi
avanemist ning transkriptsiooni initsiatsiooni, sest GC-rikas ala takistab ahelate
lahtisulamist, mis päädib RNAP dissotseerumisega DNA-lt. Ühe hüpoteesi kohaselt
ppGpp seondub diskriminaatorjärjestuses olevate C-nukleotiididega ning takistab
sedasi promootori vabastamist.
Promootorid, mida ppGpp pärsib, on diskriminaatorjärjestusega
promootorid, mis on aktiveeritavad negatiivse superspiralisatsiooniga. Tavaliselt