(kaksikahelaline RNA) või tagasivolditud (linguvõi juuksenõela-kujuline) RNA väikesteks ~ 21 25 nt fragmentideks siRNA-d kaitsevad genoomi: · Löövad tagasi sissetungivad viirused · Vaigistavad ,,hälvik-transkripte · Vaigistavad transposoone ja korduselemente siRNAd samuti hoiavad mõnede geenide epigeneetiliselt vaigistatud staatust. Enamus taimeviiruseid on RNA viirused, mis paljunevad läbi kaksikahelalise vaheetapi. Kaksikahelaline RNA (dsRNA) lõigatakse Diceri (DCL) valgu poolt, et tekitada siRNA molekule, mis seonduvad AGO valguga, et vaigistada viiruse replikatsiooni ja ekspressiooni. Viiruse infektsioon tekitab süsteemset siRNA kogunemist Viirustel on valgud, mis suruvad alla RNA vaigistamise. Kokkuvõte viiruse poolt indutseeritud geenivaigistamisest · RNA-vahendatud geenivaigistamine on oluline, et kaitsta taime patogeenide eest. · siRNA-d segavad viiruse paljunemist.
koosseisust. RISC kompleksil arvatakse olevat 2 funktsiooni : 1) siRNA funktsioon (ehk RNA interferents), 2) miRNA funktsioon, mille tagajärjeks on üksikuid mitte-paardunud nukleotiide sisaldavate märklaud mRNAde translatsiooniline repressioon. RNA interferents arvatakse olevat iidne raku mehanism taimedel ja loomadel, millega rakk kaitseb end teatud viiruste ja mobiilsete geneetiliste elementide vastu. Taimed, milledes on tuvastatud Diceri või RISC kompleksi valkude mutatsioonid, on oluliselt tundlikumad RNA viiruste infektsioonile ja transposoonide liikumisele nende genoomis. Taimede kaksikahelaline RNA indutseerib ka sama järjestust sisaldava genoomse DNA metüleerimist. Viimase mehanism ei ole teada. Selline RNAivahendatud geenimetüleerimise mehanism ei esine imetajatel. RNAi tsütoplasmas toimuv posttranskriptsioonilise geeniekspressiooni regulatsiooni mehhanism, mille käigus