4 bits) X2: 38 (14.6 bits) X3: 64 (24.7 bits) S1: 41 (20.4 bits) S2: 79 (35.0 bits) b. Uurida leitud oletatavaid konserveerunud domeene, millistes vahemikes asetsevad? Mis piirkond on märgitud umbes 500 aminohappe juures? Millised on tõenäoliselt uuritavad valgud ja miks? VASTUS: Konserveerunud domeenid 500 aminohape juures on valgu piirkond mis, ei sarnane mitte ühtegi valguga. Uuritavad valgud on TIM, Triosephosphate isomerase, CDP-diacylglycerol pyrophosphatase, TpiA, Triosephosphate isomerase, selle pärast, et nendel on kõige suurem skoor. c. Kirjeldada lühidalt leitud valkude funktsioone (NCBI lingid, võib otsida infot ka teistest andmebaasidest), milline neist on seotud glükolüüsiga? VASTUS: Leitud valkude kirjeldused (lingid): pfam00121, TIM, Triosephosphate isomerase http://www.sanger.ac.uk/cgi-bin/Pfam/getacc?PF00121
H2C O C R1 H2C O C R1 O O O HC O C R2 H2O HC O C R2 + - O C R3 O Proteaasid: H2C O C R3 H2C OH Endoproteaasid katalüüsivad sidemete hüdrolüüsi peptiidahela keskel, eksoproteaasid ahela triacylglycerol lõpus. 1,2-diacylglycerol fatty acid Karbonaadi hüdro-lüaas: Aitab CO2 eemaldamisel kudedest ja transporti punastest vererakkudest kopsudesse, kofaktoriks on Zn2+ . CO2 + H2O HCO3 + H+ Ratsemaasid: 3. Eksperimentaalsed meetodid ensümoloogias: Eksperimendi eesmärgid: a) ensüümi kontsentratsiooni ja aktiivsuse määramine · ensüümi puhastamise jälgimine · meditsiiniline diagnostika b) substraadi hulga/kontsentratsiooni määramine