Molekulaardiagnostika kordamisküsimused
ekspresseeritakse rakkudes
------Kimäärne valk seostub kromatiiniga ja metüleerib naabruses asuva adeniini.
------Metülatsioonitundlik DpnI lõikab DNA metüleeritud GATC saitides.
------Fragmendid eraldatakse suuruse järgi, märgistatakse ja hübridiseeritakse kiipidega
24
L-DNA-l baseeruv universaalne kiip:
Algne hübridisatsioon toimub lahuses, mille järel märgistatud proovid deotakse kiibile.
Proovid koosnevad spetsialiseeritud D-DNA osast ja n.ö. koodi osast L-DNAst, mille
kaudu toimub tahkele kandjale sidumine. Vähendab olulist müra ja tõstab spetsiifilisust.
Kromatiini immuunsadestamine kiipidel (ChIP-on-chip):
Genoomne DNA inkubeeritakse valguga ning stabiliseeritakse cross-linkimise teel. Valk
pretsipiteeritakse spetsiifilise AK-ga ning lagundatakse. DNA ahel märgistatakse ja
hübridiseeritakse kiibile.
Tundmatute eksonite identifitseerimine kiipidel: