Biosüstemaatika teooria ja meetodid
Wagneri võrgu - Wagner network),
ja alles lõpuks juuritakse see meie poolt näidatud välisrühma ja siserühma
vahelt. Kui me kuidagi ei oska välisrühma analüüsi jaoks eristada, võib puu
lõpuks juurida keskpunktist; sellest mistahes taksonini (harutipuni) on
sama palju muutussamme.
8.10. Juurega puu puhul võime PAUPi kasutades anda käsud, mis võrdselt
lühimate puude saamisel paneb kladogrammide genereerimisel programmi eelis-
tama tunnuste paralleelset teket reversioonile (DELTRAN), või tagasipöördu-
mist (reversiooni) paralleeltekkele (ALLTRAN).
8.11. Arvutiprogrammile võib "ette kirjutada" ka mitmesuguseid piiran-
guid ja "sundkäike". Võime nõuda, et teatud liigid või liigirühmad peavad
olema ühes harus (klaadis) koos; et teatud rühmad peavad olema kõrvutistes
sõsarokstes (harudes). Sellised "sundused" (constraints) on tavaliselt õi-
24
annaabi.ee 
