Molekulaardiagnostika kordamisküsimused
-puudused: Puudulik tundlikus,Väikesed fragmendid
dHPLC:
-eelised: Kiire ja kvantitatiivne
-puudused: Kallis, ei selgu asukoht
SSCP:
-eelised: Lihtne ja odav
-puudused: Väikesed fragmendid
DGGE:
-eelised: Kõrge tundlikus
-puudused: Kallid praimerid
17.TaqMan ja Molecular Beacon töötamisprintsiip
Homogeensed hübridisatsioonitestid kasutades reaalaja PCR-d ja fluorestsentsil
põhinevat detektsiooni:
-Tuntumad TaqMan ja Molecular Beacon proovid.Erinevad quencherid (TAMRA ja
DABCYL)
-Põhinevad energia ülekandel, kus fluorestsents detekteeritakse tänu muutusele
füüsikalises distantsis fluorokroomi ja vaigistaja (quencher) vahel pärast
proovide hübridisatsiooni. FRET (fluoresence resonance energy transfere) tehnika
-Iga SNP vajab spetsiaalpraimereid
-Kõige efektiivsemad väheste SNP-de ja suure hulga proovide puhul
Introduction to TaqMan® probes
TaqMan® probes are dual labeled hydrolysis probes and are a registered trademark of the Roche
Molecular Systems, Inc