"cophenetic" - 1 õppematerjal

Biosüstemaatika teooria ja meetodid

enamasti uuritud OTUde selge rühmitumise ilusateks klastriteks. See kõlbab siis, kui tahame näiteks mõnda perekonda jagada alamperekondadeks või sekt- sioonideks. 7.3.1. Erinevatel meetoditel saadud fenogramme võime hinnata nende vas- tavuse alusel algandmestikule. Leiame korrelatsiooni kõigi OTUpaaride vahe- liste kauguste vahel fenogrammis ja algses andmemaatriksis; vastav kofenee- tilise korrelatsiooni koefitsient (cophenetic correlation coefficient) on seda suurem (teoreetiliselt kuni 1,0), mida vähem on klasterdamine moonuta- nud liikidevahelisi sarnasussuhteid. 7.3.2. Erinevatel meetoditel samade OTUde kohta saadud erineva informat- siooniga fenogramme võime liita üheks, konsensuspuuks (vt. joon. 3). Selles on omaette klastritena näidatud need harud (klastrid), mis on ühised kõi- gile eri fenogrammidele. Võime genereerida ka sellise konsensuspuu, kus on esitatud 50 %, 90 % jne