"clustal" - 1 õppematerjal

Bioinformaatika arvestus ül

tcatggcccttacgaccagggctacacacgtgctacaatggcgcatacaaagagaagcga cctcgcgagagcaagcggacctcataaagtgcgtcgtagtccggattggagtctgcaact cgactccatgaagtcggaatcgctagtaatcgtggatcagaatgccacggtgaatacgtt cccgggccttgtacacaccgcccgtcacaccatgggagtgggttgcaaaagaagtaggta gcttaaccttcgggagggcgcttaccactttgtgattcatgactggggtgaagtcgtaac aaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttacctta b. Sooritada antud järjestuste MSA kasutades mõnda programmi (näiteks ClustalW, EBI). Vastus: CLUSTAL W (1.83) multiple sequence alignment eco_b0201 AAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAA 60 ece_Z0213 AAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAA 60 sfl_SF4435 AAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAA 60 stm_STM0249 ----------GTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAA 50 spt_SPA0256 -AATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAA 59