Praktiline töö - SDS-PAGE PROTEOOMIKA
Denaturatsiooniks kasutatav detergent SDS lagundab natiivseid valke, lõhkudes valkudel nii
sekundaar- ja tertsiaarstruktuuri kui ka kvarternaarstruktuuri.
Polüpeptiidide omavaheline kovalentne seondumine vähendab valguproovi analüüsi täpsust,
kuna sama molekulmassiga bändid võivad sisaldada ühte polüpeptiidi või dimeeri/terrameeri.
Taolise probleemi ärahoidmiseks kasutatakse proovi ettevalmistamise käigus redutseerivat
agenti dithiothreitol (DTT või Clealand`i reagent) või 2-merkaptoetanooli (2-ME).
Redutseerivates tingimustes lagunevad disulfiidsidemed ning disulfiidseotud valkude
oligomeerid algunevad.
„Plaat” geeli vorm koosneb kahest paralleelsest klaasplaadist või plastiklehest, mille vahele
on asetatud tihendid (spacerid) vahemiku tekitamiseks ning geeli äravoolu takistamiseks
servadest.
SDS-PAGE elektroforeesi puhul kasutatakse kihilist kahe geeli kombinatsiooni. Esmalt
annaabi.ee 
