Bioinformaatika ülesanded
T 0 0 0 1 3 2 1 0 0 0
G 0 0 0 1 2 4 3 2 1 0
A 0 1 0 0 1 3 5 4 3 2
T 0 0 0 0 1 2 4 4 3 4
Maksimumskoor on 4
CG T G A
| | | | |
CGTGA
7. Sooritada punktis 2 toodud järjestustega paarikaupa globaalne joondamine kasutades
vastavat programmi (näiteks EMBOSS'i Align EBI kodulehel
http://www.ebi.ac.uk/emboss/align/). Varieerida skoorimaatrikseid ja tühikutrahve
ning põhjendada erinevusi, võrrelda dot-ploti tulemustega, millise nähtusega on
tegemist? Kontrollida punktis 5 tehtud tööd.
Vastus:
2. punkti esimese järjestuste paari globaalne joondamine: