"cgtc" - 1 õppematerjal

Bioinformaatika ülesanded

T -5 -3 -1 0 2 4 3 2 1 0 -1 -2 C -6 -4 -2 -1 1 3 5 4 3 2 1 0 C -7 -5 -3 -2 0 2 4 5 4 3 3 2 G -8 -6 -4 -3 -1 1 3 5 5 4 3 4 Maksimumskoor on 5 ACAGTCGAAC G | | | | | | | AC CGTC _ _ _CG 6. Leidke käsitsi kahe järjestuse lokaalne joondamine Smith-Watermani algoritmi järgi ­ kokkulangevus = +1, mittekokkulangevus = -1, tühik = -1. ACGTGACAT CGTGAT Vastus: ACGTGACAT _ CGTGA_ _ _ A C G T G A C A T  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0