Koostu tegemine algusest peale: mida iga bioloog peaks teadma
raames erinevad tarkvara arendajad moodustasid võistkondi ja proovisid enda programmiga saavutada
häid tulemusi. Töötlemiseks kasutatud andmed olid selleks spetsiaalselt stimuleeritud andmestik mitte
päris genoomid. Andmete valikut on kritiseeritud Assemblathon 1 puhul, kuna tehislikud andmed ei
suuda kunagi peegeldada tegelikku olukorda piisavalt rahuldaval tasemel. Assemblathon 2 projektis
pidi töötlema ka tõelisi sekveneerimisandmeid, mis pärinesid näiteks papagoilt ja boamaolt.
Järeldused
Assemblathon, GAGE ja dnGASP jõudsid kõik ühele järeldusele ka kõige paremad koostud
sisaldavad olulisi ja rohkelt vigu. Iga bioloog peaks silmas pidama, et täiuslikku genoomi ei saa
nendega koostada. Samuti järeldus, et ideaalset ainuõiget meetrikut ei eksisteeri. Stateegiad, mis
teevad vähem vigu, teevad seda pikkuse arvelt. See halvendab edasise analüüsi kvaliteeti, sest
informatsiooni on vähe