Mikroobifusioloogia
insektsiidse tähtsusega.
Endofüüdid võivad taimedes olla kas obligatoorsed ehk teisisõnu
mikroorganismid, mis vajavad taimedes elamist teatud elutsükliks. Sellised
endofüüdid pole võimelised ilma taimedeta elama. Obligatoorseid endofüüte on
väga palju kirjeldatud seente hulgas. Teiseks äärmuseks on oportunistlikud
endofüüdid, mis ei vaja taime kudedes elamist, kuid siiski võivad sattuda
taimedesse. Sellisteks bakteriteks on perekonna Pseudomonas ja Azospirillium
liigid, mis on tüüpilised risosfääri bakterid. Enamikel juhtudel on tegu
vahepealsete juhtudega ehk fakultatiivsete endofüütidega. Tänapäeval
vaieldakse, kas fakultatiivsed endofüütsed bakterid kasutavad taimi kui vahendit
levimiseks või on pigem tegemist taime aktiivse valikuga. Igal juhul fakultatiivsed
endofüüdid kasutavad taime ,,pakutud" toitaineid energiaallikaks. Tõenäoliselt on
ka fakultatiivsed endofüüdid taimedele kasulikud, sest vastasel juhul taimede
annaabi.ee 
