Mikroobifusioloogia
Pärast lõiget jääb DNA 3' ots
seotud relaksaasiga tugeva mittekovalentse sideme abil. R388 TrwC jääb DNA 5'
otsaga seotuks Tyr amh-jäägi kaudu kuni DNA translokatsiooni lõpuni.
Relaksaasil on helikaasne domeen 5'-3' suunalise helikaasse aktiivsusega,
ATP-st sõltuv. Relaksaasi TraI domeenid ei seondu korraga oriT-le, vaid enne
seondub endonukleaasne domeen ja siis helikaasne domeen. F-plasmiidi TraI
vajab signaali, mis aktiveeriks autoinhibeeritud TraI helikaasse aktiivsuse.
Tõenäoliselt on selleks vaja relaksaasi seondumist T4CP valguga.
Abivalgud R388 plasmiidi korral on relaksaasil TrwC vaja seondumiseks
abivalku TrwA, kuigi on näidatud, et TrwC on võimeline iseseisvalt oriT-ga
107
seonduma ning DNA üksikahelalise katke tegema. TrwA seondub oriT-l kahte
piirkonda: sbaA-le, mis on tugeva afiinsusega ning sbaB-le, mis on nõrga
afiinsusega