"atagcaaaat" - 1 õppematerjal

BIOinformaatika kodutöö 5

661 accggtcagg caaaccatct ggcggcaacc atcggtgcag atatcgtcaa acaaaaaatg 721 gcggaaaata acggcggcta taaagcaatt aattacggtt acaccgacga tcgtgtttac 781 agcaaattga ccagcgaaaa cccgattgat ctggtgcgtt atcagttagc taactgctat 841 atgggtcggg ctgggttgat aaactccggc ggtgctgcgg gcggtgaaac tgacctcagc 901 gatgcagtgc gtactgcggt tatcaacaaa cgcgcaggcg gaatggggct gattcttgga 961 cgtaaagcgt tcaagaaatc gatggctgac ggcgtgaaac tgattaacgc cgtgcaggac 1021 gtttatctcg atagcaaaat tactatcgcc tga 3. SPdbV (http://www.expasy.org/spdbv/) kasutamine. a. Leida vastavate valkude ruumiliste struktuuride PDB failid (alternatiiv http://www.rcsb.org/pdb/) ja laadida need arvutisse ning kirjeldada neid (peaahela käik, sekundaarstruktuuride olemasolu ja ulatus, elektrostaatilised ja molekulaarsed pinnad). Peaahela käik Sekundaarstruktuurid Elektrostaatilised pinnad Molekulaarsed pinnad 4. Andmete otsimine NCBI-st Entrezi kaudu (http://www.ncbi.nih