et alati haigestutakse; (2) looduslik valik: isenditel, kellel on haigus D, jäävad suurem tõenäosusega ellu ja saavad järglasi kui neil on ka alleel A; (3) Populatsiooni kihistumine: populatsioon sisaldab mitmeid alahulki ja juhuslikult on nii D ja A ühes alahulgas; (4) tüüp 1 viga: tavaliselt testitakse suure hulga markerite seost haigusega ja kui ühelgi pole tegelikult tõest seost, siis 5% tulemustest on olulised. Assotsiatsioonuuringuid on kergem läbi viia kui aheldusanalüüsi, kuna ei vajata spetsiaalseid perekondi. Oluline on kontrollrühma valik. Assotsiatsiooniuuringul kaks lähenemist. Esimene on common disease – common variant hüpoteesil põhinev ehk enamus vastuvõtlikkuse faktoreid on ancient variatsioonid, mis esinevad ancient kromosomaalsetel segmentidel. Kusjuures üldiselt ei pea need mutatsioonid midagi halba põhjustama, aga kuna ühiskond