Koostu tegemine algusest peale: mida iga bioloog peaks teadma
väljatöötamine. Uued sisendandmed, mis söödetakse programmidele, on teistsuguste iseärasuste ja
vigadeprofiiliga kui sekveneerimise teerajajaks osutunud Sangeri meetodi lugemid (read). Seega
peavad tarkvarade loojad pidevalt olema arengutega kursis ja kohastuma nii, et loodavad programmid
suudaksid andmeid õigesti töödelda. Kuna sisendandmed on kiires muutumises, on keeruliseks
osutunud ka seniste koostute kvaliteedi hindamine. Kui genoom saab assembleeritud ehk taas
kokkupandud, mille alusel võivad teadlased väita, et tegemist ongi absoluutselt õige koostuga?
Meetrikud, mille alusel antakse koostutele kvaliteedihinnanguid ei ole sugugi mitte alati üksteist
võimendavad. Esineb lõivsuhe õigsuse (vigade puudumise) ja pikkuse parameetrite vahel. Järgmiseks
oluliseks hetkeks on otsuse langetamine, kumb iseloomustaja on olulisem, kas pikkus või vigade
puudumine?
Koostu tegemine algusest peale ehk de novo assembly
annaabi.ee 
