Morfoloogia
esindab omavahel variatsioonisuhtes olevaid foneeme.
Morfofonoloogilised realisatsioonireeglid kirjeldavad, missugustel tingimustel ja mis
kujul morfofoneemid realiseeruvad. Esinemisümbruse tingimusi kirjeldades on võimalik
viidata fonoloogilistele, morfoloogilistele ja süntaktilistele omadustele. Morfofoneemid
vastavad abstraktsusastmelt arhifoneemidele, kuigi neil ei ole keele fonoloogias niisama
loomulikku tagapõhja kui arhifoneemidel. Morfofoneemide ja arhifoneemide vahel ei ole
seega radikaalset erinevust. Morfofoneemid võivad morfoloogiakirjelduses tunduda mõnikord
abstraktsetena, kuid nende kasutamine on vahel möödapääsmatu.
Allomorfivahelduste kolmas, eelmistest palju harvem liik puudutab neid juhtumeid,
mille puhul teatud allomorf esineb vaid koos kindlate lekseemidega (child+ren, ox+en). Need
allomorfid on klassikalised erandid, ühejuhureeglid. Leksikaalselt määratud allomorfi