Biosüstemaatika teooria ja meetodid
moodustavad monofüleetilise rühma. Niisiis on konsensuspuu hea abinõu mono-
füleetiliste rühmade väljaselgitamisel.
8.14.2. Lisaks rangele konsensuspuule kasutatakse ka teisi. Kujutleme,
et paljudes kladogrammides on mingi klaad (haru, seega oletatavalt monofü-
leetilise rühma sisese fülogeneesi hüpotees) sama topoloogiaga, ainult ühes
kladogrammis tuhandest on see detail erinevana kujutatud. Ranges konsensus-
puus loetakse see klaad lahendamata alljaotuseks. Ilmselt oleks õigem ar-
vestada ka kladogrammidevaheliste erinevuste esinemissagedust.
PAUP pakub võimalust konstrueerida 50 %-enamusreegli konsensuspuud. Sel-
les näidatakse neid klaade (harusid), mis esinevad vähemalt 50 % puudes, ja
iga klaadiharu juures on märgitud esinemissageduse protsent. Programmile
võib anda ka käsu 50 % asemel piiriks võtta 95 %, mis tundub mõistlikult
range piiranguna.
8.15. Kladistilise analüüsi tulemusena saame parimal juhul üheainsa kla-
annaabi.ee 
