Mikroobifusioloogia
74
Tavaliselt seonduvad aktivaator ja RNAP DNA-le samaaegselt. Sellest
johtuvalt seonduvad aktivaatorid tavaliselt promootorist ülesvoolu ega takista
RNAP seondumist promootorile. Kui aktivaator seondub promootori -35 elemendi
lähedale, siis tavalisel toimub aktivaatori ja RNAP -subühiku C-terminuse vahel
interaktsioon, mis soodustab RNAP seondumist või avatud kompleksi
moodustumist. Transkriptsiooni akitveerimine võib toimuda ka aktivaatori ja RNAP
mõne teise interaktsiooni tulemusel kui -subühiku C-terminusega. Näiteks
interaktsioon -subühiku N-terminusega, - või '-subühikuga või isegi -
subühikuga.
Aktivaatori seondumise kaugus promootorist, mille abil toimub
transkriptsiooni aktiveerimine, on erinev. Sellest tulenevalt on mehhanism, mille
abil transkriptsiooni aktiveeritakse, pisut erinev. Crp (tuntud ka kui CAP inglise