Meditsiinilise mikrobioloogia praktikum
elektroforees ja Southern’ hübridisatsioon. Hübridisatsiooniks kasutatakse sonde, mis seostuvad
ribosoome kodeerivate geenidega.
Restriktsioonile järgneb elektroforees agaroosgeelis, mis võimaldab tekkinud DNA fragmentide
eraldamise nende suurusest lähtudes.
PFGE – PULSED FIELD GEL ELECTROPHORESIS. Pulss-välja geelelektroforees on
molekulaarsete tüpiseerimismeetodite standardiks. Terviklikest bakterirakkudest valmistakse nn.
agarpunnid. Seejärel tehakse bakteri DNA-le restriktsioon. Elektroforees toimub pulseeriva
elektrivälja tingimustes. PFGE võimaldab lahutada väga suure molekulmassiga DNA fragmente
vahemikus 10 kb kuni 800 kb.
Joonis 4. PFGE restriktsioonimustrid S.
aureus puhangu korral haiglas.
Stafülokoki tüvede lõikamisel restrikt-