Meditsiinilise mikrobioloogia praktikum
Tausta helenduse vähendamiseks võib EtBr-ga värvitud geeli loputada 20 min
toatemperatuuril destilleeritud vees.
• Polüakrüülamiidgeelide hõbetamist. See on tehniliselt keerulisem kui EtBr-ga värvimine,
kuid samas tundlikum.
Geelelektroforeesi protokoll
MATERJALID JA APARATUUR
PUHVRID JA LAHUSED.
• Agaroosgeel saadakse agaroosi kuumutamisel koos puhvriga, kuni lahus on selge ja
läbipaistev. Seejärel valatakse agaroosilahus geelialusele ja lastakse tarduda.
• Elektroforeesipuhver (tavaliselt 1× TAE või 0,5× TBE).
• Etiidiumbromiid,
• Geeli pealekandmispuhver (gel loading dye)
MOLEKULMASSI MARKER.
• DNA suurusmarker (size standard). Teadaoleva suurusega DNA proovid saadakse tavaliselt
plasmiidi või bakteriofaagi DNA lõikamisel restriktsiooniensüümidega. Hea oleks omada nii
kõrgmolekulaarmassiga 1 kb - >20 kb fragmendi pikkusega standardit kui ka madala