Mikroobifusioloogia
Sellest johtuvalt peab
bakter balansseerima hapnikust saadava kasu ja toksilisuse vahel. Keskkonnas
oleva hapniku kontsentratsioonist sõltuvalt on bakterid kohanenud molekulaarse
hapniku olemasoluga või puudumisega ning vastavalt sellele kasutavad
membraanset või substraatset fosforüülimist.
Obligaatne aeroob vajab O2 kasvuks, kasutavad molekulaarset hapnikku
elektroni lõpp-aktseptoriks aeroobsel hingamisel.
Obligaatne anaeroob (vahel nimetatud ka aerofoobiks) ei kasuta O 2
energiaks. Molekulaarne hapnik on obligaatsetele anaeroobidele toksiline, mis
tapab või inhibeerib kasvu. Sellised bakterid saavad energiat kääritamise,
anaeroobse hingamise, fotosünteesi või metanogeneesi abil (energia saamine
metaani lagundamisest).
Fakultatiivsed anaeroobid (või ka fakultatiivsed aeroobid) on bakterid,
mis võivad eluks kasutada nii aeroobset kui ka anaeroobset metabolismi.