Mikroobifusioloogia
16.2. Endofüüdid
Endofüütseid baktereid on leitud väga erinevatest taimehõimkondadest:
lehtsammaltaimedest (Bryophyta), sõnajalgtaimedest (Pteridophyta),
paljasseemnetaimedest (Gymnospermae) ja katteseemnetaimedest ehk
õistaimedest (Angiospermae).
Taimedest on leitud väga palju erinevatest hõimkondadest baktereid. 16S
rRNA sekveneerimise abil on kirjeldatud taimede kudedest 21 eubakterite
hõimkonda ja 2 arhede hõimkonda, nagu näiteks Acidobacteria, Actinobacteria,
Bacteroidetes, Chlamydiae, Frimicutes, Proteobacteria, Spirochaetae jpt. Kuigi
taimedes on väga kirju seltskond baktereid, moodustavad valdava osa
endofüütidest ainult 4 hõimkonna liigid: Proteobacteria (54%), Actinobacteria
140
(20%), Firmicutes (16%) ja Bacteroidetes (6%). Samad hõimkonnad on valdavalt
ka taimede risosfääris. Arhesid on kirjeldatud ainult üksikutel juhtudel, neid on
annaabi.ee 
