"accgtc" - 1 õppematerjal

Bioinformaatika ülesanded

output ######################################## #======================================= # # Aligned_sequences: 2 # 1: EMBOSS_001 # 2: EMBOSS_001 # Matrix: EBLOSUM62 # Gap_penalty: 10.0 # Extend_penalty: 0.5 # # Length: 11 # Identity: 7/11 (63.6%) # Similarity: 7/11 (63.6%) # Gaps: 3/11 (27.3%)  # Score: 37.0 # # #======================================= EMBOSS_001 1 ACAGTCGAACG 11 ||.||| || EMBOSS_001 1 ACCGTC---CG 8 #--------------------------------------- --------------------------------------- Järeldus: 5. punktis tehtud töö on õige, kuna sain samade parameetritega sama vastuse. 8.Sooritada punktis 2 toodud järjestustega paarikaupa lokaalne joondamine kasutades vastavat programmi (näiteks EMBOSS'i Align EBI kodulehel http://www.ebi.ac.uk/emboss/align/). Varieerida skoorimaatrikseid ja tühikutrahve ning põhjendada erinevusi, kontrollida punktis 6