"acagag" - 1 õppematerjal

Bioinformaatika ülesanded

 cgactaccgatatggcattgatcagagtcaagctgatcacaagatagatcatttaggacaactgtgtgt aaaaatcggttgttttggatcgtga Vastus : Peadiagonaal puudub. Tegemist on keerulisema mutatsiooniga, transpositsiooniga. 3. Leida, milline joondamiste paar on sarnasem. Kuidas diferentseerida tühiku trahvi. Kokkulangevus = +1, mittekokkulangevus = -1. 1.AGATAGAAACTGATATATA 2.AGATAGAAACTGATATATA AGA-A-A-ACAGAG-T--- AGA--GA-AGTGAG-T--- Oletame, et 1 tühiku trahv on -1 ja tühikute seeria pikkuse trahv on -2 Siis: (kokkulangevus) (mittekokkulangevus) (tühik) (seeria pikkus) S1= 10 *1 + 2* (-1) + 7*(-1) + 5*(-2) = -9 (kokkulangevus) (mittekokkulangevus) (tühik) (seeria pikkus) S2= 10*1 + 2* (-1) + 7*(-1) + 4*(-2) = -7 4