Ensümoloogia
tuletatakse lähtuvalt reaktsioonist mingi kindla skeemi alusel. Nimetuse järgi võib tuletada reaktsiooni, mida
ensüüm katalüüsib. Nimetusest võib põhimõtteliselt välja lugeda struktuuri, aga see läheb väga kohmakaks.
Triviaalnimetuse puhul on see vahest võimalik ja vahest pole, biokeemias kasutatakse valdavalt triviaalnimetusi.
Mõningaid reegleid ensüümide nimetuste koostamiseks
CH3COO- atsetaat, füsioloogilisel pH-l lähevad aatideks.
1. FADH, NADH, DNA, üldkasutatavad nimetused.
2. Kui ensüüm katalüüsib rohekm kui ühte tüüpi reaktsiooni, tuleb nimetus koostada ainult ühest
reaktsioonist. Sama kehtib ka alternatiivsete substraatide kohta. Kui väiksema spetsiifilisusega ensüüm, siis
antakse substraadi nimi üldisemalt alkoholi dehüdrogenaas (pole spetiifiline ühele kindlale alkoholile).
3